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PROTAC(Proteolysis Targeting Chimera,靶向蛋白降解技術(shù))是一種突破性的藥物研發(fā)策略,通過(guò)將目標(biāo)蛋白與E3泛素連接酶招募至同一復(fù)合物,實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)的泛素化并靶向降解。相比傳統(tǒng)的小分子抑制劑,PROTAC 可以將“不可成藥”的蛋白(如支架蛋白和轉(zhuǎn)錄因子)轉(zhuǎn)化為可降解的靶標(biāo),具有多次作用和高特異性的獨(dú)特優(yōu)勢(shì)。
PROTAC分子設(shè)計(jì)與合成
? 分析潛在E3連接酶的表達(dá)和功能(如VHL、CRBN),為分子設(shè)計(jì)提供依據(jù)。
? 針對(duì)目標(biāo)蛋白和E3連接酶,開(kāi)發(fā)高親和力結(jié)合基團(tuán)(ligand)。
? 優(yōu)化分子中的連接子長(zhǎng)度和化學(xué)性質(zhì),提升靶標(biāo)結(jié)合效率和細(xì)胞滲透性。
? 支持文庫(kù)構(gòu)建、高通量篩選和先導(dǎo)分子優(yōu)化需求。
靶向蛋白降解驗(yàn)證
? 體外驗(yàn)證:通過(guò)Western blot、In cell western、HTRF等方法檢測(cè)PROTAC對(duì)目標(biāo)蛋白降解的效率和特異性,并分析劑量依賴性和時(shí)間依賴性(如DC50和Dmax參數(shù))。
? 競(jìng)爭(zhēng)實(shí)驗(yàn):驗(yàn)證目標(biāo)蛋白降解是否依賴于PROTAC中E3連接酶和靶點(diǎn)結(jié)合基團(tuán);使用E3連接酶抑制劑或突變靶點(diǎn)蛋白進(jìn)行對(duì)照實(shí)驗(yàn),確保機(jī)制可靠性。
? 功能性研究:評(píng)估目標(biāo)蛋白降解后對(duì)細(xì)胞功能的影響,例如增殖、凋亡和遷移能力的改變。
? 組學(xué)分析:通過(guò)轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué),揭示PROTAC分子對(duì)全局基因和蛋白表達(dá)的影響。
(1)先進(jìn)分子設(shè)計(jì):結(jié)合動(dòng)力學(xué)模擬和化學(xué)優(yōu)化,快速開(kāi)發(fā)高效PROTAC分子。
(2)全面驗(yàn)證體系:從體外降解實(shí)驗(yàn)到體內(nèi)藥效驗(yàn)證,覆蓋全流程評(píng)價(jià)體系。
(3)創(chuàng)新靶點(diǎn)開(kāi)發(fā):開(kāi)發(fā)傳統(tǒng)藥物難以靶向的“不可成藥”靶點(diǎn)。
(4)高效項(xiàng)目推進(jìn):通過(guò)高通量篩選平臺(tái),加速候選分子的發(fā)現(xiàn)和優(yōu)化。