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新聞資訊

轉化醫學——加速創新藥物和精準醫學研發進程

2022-12-16
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轉化醫學以藥物研發過程中生物標志物為核心,以精準醫療提高藥物研發臨床應答率為目標,覆蓋從早期靶點確認——臨床前R&D ——臨床I、II、III期Development,到上市后的藥物檢測,通過不同階段的研究實現藥物研發的閉環。

美迪西轉化醫學平臺擁有經驗豐富的專業化技術團隊,從藥物靶點的作用機制和生物標志物的臨床應用出發,以生物標志物的發現和驗證為基礎,結合多種不同的技術平臺和先進的儀器, 創建了多種生物分析方法,降低了藥物研發的成本和時間,為不同類型的藥物、不同類型的藥企和不同研發階段的項目提供多元高效的服務。

隨著基因組學、蛋白質組學和代謝組學等多組學分析技術不斷地發展,治療方式已經從傳統小分子擴展到多肽、蛋白、抗體、基因療法、細胞療法等多種新型技術。盡管有這些新技術,但仍有大量疾病的致病原因還無法徹底明白。轉化醫學將生物醫學觀察和研究轉化為改善健康的干預措施的過程,加速了基礎研究、新藥開發的和臨床轉化的進程,成為精準靶向治療的加速器。轉化醫學研究利用各種研究手段,確定靶點與疾病發生發展的關系、驗證和探索藥物的作用機制、發現生物標志物并開發伴隨診斷產品,以及為臨床研究開展篩選最合適的人群和適應癥等,從而提高新藥研發效率和成功率。

將轉化醫學里程碑疊加到藥物開發階段.jpg

將轉化醫學里程碑疊加到藥物開發階段[1]

生物標志物研究平臺

生物標志物(Biomarker)通常是指能被客觀測量和評價,反映生理或病理過程,以及對暴露或治療干預措施產生生物學效應的指標。生物標志物多來源于人體組織或體液,可涵蓋生理、生化、免疫、細胞和分子等水平的改變。

生物標志物的檢測可廣泛地應用與病人的篩查、診斷、臨床研究、指導用藥、預后等領域??商岣呋诨蚪M學、蛋白組學、細胞組學、病理組學等多組學的生物標志物發現及驗證服務。為生物標志物研究提供科學支持,多層面助力新藥研發臨床試驗。生物標志物作為最直接快速有效的診斷手段,其篩選與獲得可在疾病診斷、發展、治療、以及療效監測等多個方面發揮重要的作用。生物標志物有基于DNA的、有基于RNA的、還有基于蛋白質的,不同的分子和蛋白需要不同的技術平臺。隨著高通量基因組學、蛋白質組學等的不斷進展,生物標志物包括的種類也越來越多,例如SNP、外泌體、miRNA、lncRNA等都被列入生物標志物的行列。目前已有多種技術平臺被應用于生物標志物研究,如包括基因組學、蛋白質組學、肽組學、代謝組學等在內的組學平臺,以及包括納米技術、生物信息學、抗體芯片、高內涵篩選技術、無標記相互作用分析技術等多種前沿技術在內的手段與方法,都為快速獲得及篩選生物標志物帶來了極大的可能。

生物標志物的分類及用途

? 診斷性生物標志物:用于檢測或確認疾病狀態,或識別不同疾病亞型。

? 預后性生物標志物:反映疾病預后特征、疾病復發或進展風險。

? 預測性生物標志物:用于預測患者對某種治療或干預措施可能產生某種療效應答。

? 藥效學生物標志物:反映患者在接受治療后產生某種生物學應答。

? 安全性生物標志物:用藥前或用藥過程中監測從而避免或降低患者發生不良反應。

? 監測性生物標志物:監測疾病狀態變化(如復發等)。

美迪西生物標志物舉例

? PD1/PD-L1

? ErbB2/HER2

? p-FGFR1/FGFR2/FGFR3、p-ERK、p-CREB、p-AKT

? EGFR

? VEGF

? p53

? Cyclin D1

? COX-2

? Cytokeratin 7(CK7)

? K-Ras

? SOX2

? MET

? Fas

? ER-α

? Ki-67等

美迪西生物標志物舉例.jpg

美迪西案例

Biacore T200

WBC100 是一種新型口服有效的分子膠,可選擇性地降解 c-Myc 蛋白而對其他蛋白無作用活性,并有效殺死c-Myc過表達的癌細胞。SPR結果顯示 WBC100 與 c-Myc 蛋白結合,且存在劑量依賴性。此SPR實驗正是通過美迪西使用Biacore T200儀器進行的。

Surface-plasmon-resonance-(SPR).jpg

Surface plasmon resonance (SPR)[2]

Biacore-8K

Biacore-8K.jpg

? 8 needles and 16 flowcells, study 8 targets at the same time;

? High-throughput, 500 compounds/day;

? Fast detection speed,finish one affinity and kinetic test in 2-15 minutes.

PD-1 和 VEGF結合實驗

PD-1-和-VEGF結合實驗.jpg

A: Binding kinetics of different doses of Nivolumab with PD-1 (Biacore 8K)

B: Binding kinetics of different doses of Aflibercept with recombinant human VEGF (Biacore 8K)

生物分析技術平臺

美迪西生物分析部可以為客戶提供小分子藥物、大分子生物制品、生物標志物的篩選與開發,以及臨床前和臨床階段的研究服務??梢蕴峁┓螰DA/NMPA GLP的生物技術藥物生物分析服務,以支持蛋白藥物、抗體藥物、疫苗、生物標志物、細胞和基因治療藥物的早期開發,及其臨床前研究和臨床研究。

服務能力

? 免疫分析方法的開發及方法學驗證

? 蛋白、抗體、ADC、多肽藥物、核酸、疫苗及細胞與基因治療產品等的分析

? 生物標志物的篩選、驗證與分析、細胞因子檢測

? 抗藥性抗體(ADA)免疫原性分析

? 疫苗的免疫原性分析

? 病毒的活性分析

? 疫苗的效價測定

? 臨床樣品生物分析

? 支持PK 藥代動力學、TK 毒代動力學、組織分布試驗、IND申報

服務亮點

? 實驗室實行全面的信息化管理,運用驗證過的實驗室信息管理系統(Watson LIMS 7.2)建立了完善的樣品管理鏈和實驗數據的處理、跟蹤與存儲鏈;

? SensaTronics溫度監控系統;

? 驗證過的WinNonlin 軟件用于數據分析;

? 數據被FDA和NMPA接受,提供全面符合FDA/NMPA/OECD GLP規范要求的生物技術藥物分析服務;

? 獨立的小分子生物分析平臺和生物技術藥分析平臺;

?擁有SpectraMaxM4/M5/i3x, MSD, Luminex, Biacore 8K, Envision,Gyrolab,ABI7500 qPCR、ddPCR、FACS等全方位多功能的技術平臺;

? 靈活運用ELISA,ECL,IP,Co-IP,qPCR,ddPCR、FACS,Elispot、酶學、Cell-based 等多種方法,支持前沿生物藥,種類包括蛋白、抗體、ADC、多肽、核酸、疫苗及細胞基因治療藥物的早期開發,及其臨床前研究和臨床研究;

? 開發并驗證針對近百個不同靶點,如CD-4,CTLA-4,PD-1,PD-L1及T-DM1類似物ADC等的分析方法,支持PK/TK/免疫原性(Total ADA, Nab)/生物標志物/細胞因子等分析。

生物分析平臺部分儀器

生物分析平臺部分儀器.jpg

美迪西案例:臨床小肽類分子BE研究

美迪西案例:臨床小肽類分子BE研究.jpg

流式細胞技術平臺

往期文章中,我們通過從FACS 檢測 Cytokine 檢測和細胞功能檢測多個實際案例的角度出發,詳細介紹了“美迪西流式細胞技術平臺”(點擊了解)。截至目前,美迪西承接的流式檢測項目已經近400項,包括細胞表面抗原表達的流式檢測;細胞增殖、細胞分化、細胞凋亡等的流式分析;動物外周血及各免疫器官檢測;移植瘤模型流式檢測等。美迪西流式檢測團隊將每一個案例的特點與多年實戰經驗和技術積累相結合,謹慎地將優質實驗結果提交到客戶手上,持續助力客戶的研發項目獲批。

免疫組化技術平臺

免疫組化,也稱免疫組織化學技術(immunohistochemistry)或免疫細胞化學技術(immunocytochemistry)。是指應用免疫學基本原理即抗原與抗體特異性結合的原理,通過化學反應使標記抗體的顯色劑顯色來確定組織細胞內抗原(多肽和蛋白質),對其進行定位、定性及相對定量的研究。根據抗原抗體反應和化學顯色的原理,組織切片或細胞樣本中的抗原先和一抗結合,再利用一抗與二抗反應,DAB進行顯色,進而進行分析。

主要步驟

? 組織處理、固定、切片

? 抗原修復

? 除去內源性過氧化物酶

? 封閉

? 一抗、二抗孵育

? 檢測

? 復染

免疫組化技術平臺主要步驟.jpg

組織處理、固定、切片

組織固定可保存抗原,防止采集的組織自溶和壞死。組織包埋可在切片過程中對組織提供支撐,使切片更堅實。

 石蠟切片冰凍切片
固定包埋前:甲醛切片前或切片后:甲醛、甲醇、乙醇或丙酮
切片切片機冰凍切片機
儲存室溫下儲存多年-80 °C下儲存1年 (-190°C下儲存時間更長)
優勢容易操作,不會損壞切片

? 保留酶的功能和抗原性

? 實驗流程簡短(通常不需要冗長的固定步驟)

局限性

? 過度固定會掩蓋抗原表位,進而增加抗原修復的需求

? 處理時間長:在梯度酒精和二甲苯中逐步脫水,以便于石蠟滲透。

? 如果沒有快速冷凍組織”可能會形成冰晶,從而破壞組織結構

? 冰凍切片通常比石蠟切片厚,可能會導致分辨率低、圖像差

? 可能需要阻斷內源活性酶。

石蠟切片 vs冰凍切片

抗原修復

對甲醛固定的組織切片進行抗原修復,以暴露抗原位點,從而使抗體結合。

 熱誘導的抗原表位修復蛋白水解酶誘導的抗原表位修復
優勢抗原表位的修復更溫和,參數更可控。適用于較難修復的抗原表位。
ph值通常使用pH6的緩沖液,但堿性緩沖液也在廣泛使用。必須通過實驗確定pH值通常為7.4。
溫度約95°C。通常為37°C
孵育時間10-20分鐘10-15分鐘
緩沖液組分取決于靶抗原所需的pH 值。常用的緩沖液包括檸檬酸鈉、EDTA和Tris-EDTA酶(如胃蛋白酶、蛋白酶K 或胰蛋白酶)的中性緩沖液。
注意事項微波爐加熱可能會導致抗原修復不均勻。劇烈沸騰會導致脫片(組織與載玻片分離)。酶修復有時會破壞切片的形態- 濃度和時間需要優化

抗原修復的主要方法

封閉

用血清或BSA封閉,防止抗體的非特異性結合,并降低背景和潛在的假陽性結果。

? 蛋白封閉:使用血清或BSA 進行封閉對于防止抗體與組織或Fc 受體(與抗體恒定區(Fc)結合的受體)發生非特異性結合至關重要。二抗種屬來源的血清是很好的封閉試劑。使用牛血清白蛋白(BSA)或酪蛋白,可用于阻斷非特異性抗體結合。

? 生物素封閉:在使用基于親和素/生物素的檢測系統時,阻斷內源性生物素,因為內源性生物素存在于許多組織中,特別是腎臟、脾臟、肝臟和大腦中。用親和素與組織孵育,阻斷內源生物素,然后用外源生物素孵育,以阻斷親和素分子上額外的生物素結合位點。

檢測

用血清或BSA封閉,防止抗體的非特異性結合,并降低背景和潛在的假陽性結果。

? 酶顯色法:顯色檢測使用酶能夠催化可溶性底物產生有色沉淀。這些酶通常偶聯在二抗上,也可以偶聯在一抗上用于直接檢測。最常用的酶有HRP 和AP,前者將DAB 轉化成棕色產物,后者將3-氨基-9-乙基咔唑 (AEC) 轉化成紅色產物。顯色檢測通常比熒光檢測更靈敏。此外,不同于熒光染料,有色沉淀物有光穩定性,因此染色切片能夠保存多年。熒光檢測需要使用專業熒光顯微鏡和濾光片,顯色檢測僅需使用標準顯微鏡。然而,顯色檢測的孵育和封閉步驟比熒光法更多,時間也更長。

? 熒光法:熒光檢測(免疫熒光)是基于熒光基團被特定波長的光激發后發射波長較長的熒光的特性。熒光檢測常常用于需要同時檢測多種抗原的情況。熒光染料可以與一抗或二抗直接偶聯,也可與鏈霉素親和素偶聯。

儀器設備(部分舉例)

案例賞析

免疫組化技術平-案例賞析.jpg

IHC Analysis of the expression of a)PD-L1 from lung adenocarcinoma[3]; b)Ki-67 from periampullary tumors[4]; c)Her2 from lung tumor[5]; d)CD31 from human gastric adenocarcinoma[6]; e)CD163 (M2 TAM marker) from oral squamous cell carcinoma (OSCC)[7]; f)FoxP3 from human glioblastoma[8].

總結與展望

基于基因組學、蛋白組學、細胞組學及病理組學等綜合性轉化醫學平臺;高質量的研發管理團隊;美迪西轉化醫學平臺致力于為全球合作伙伴提供全方位生物標志物發現、靶點驗證、伴隨診斷開發與商業化檢測等一體化解決方案。

? 以ELISA、ECL(MSD), SIMOA(HD-X), Biacore 8K 技術構建的的蛋白質相互作用,蛋白水平生物標志物平臺;

? 以流式細胞術(BD Symphony A3,BD Fortesssa, Beckman CytoFLEX S)為主構建的細胞水平生物標志物平臺;

? 以熒光定量PCR技術構建的多重核酸水平生物標志物平臺;

? 免疫組化(TAMs-IHC,FISH)技術構建的病理水平生物標志物平臺等;

致力于解決創新藥物的研發難點,助力精準醫療!

我們很幸運地生活在一個生物醫學科學看似無限可能的時代。在這個時代,研究的問題不再主要受技術能力的限制。轉化醫學的實現需要同樣持續大膽的愿景和執行。在過去幾十年,轉化醫學取得了顯著進步,未來轉化醫學將繼續發展,并更快、更高效地為更多患者提供更多治療的可能性!

參考文獻

[1] Hugues Dolgos, et al. Translational Medicine Guide transforms drug development processes: the recent Merck experience. Drug Discov Today. 2016 Mar;21(3):517-26. doi: 10.1016/j.drudis.2016.01.003.

[2] Ying Xu, et al. A Selective Small-Molecule c-Myc Degrader Potently Regresses Lethal c-Myc Overexpressing Tumors. Adv Sci (Weinh). 2022 Mar;9(8):e2104344. doi: 10.1002/advs.202104344.

[3] Jonas J Heymann, et al. PD-L1 expression in non-small cell lung carcinoma: Comparison among cytology, small biopsy, and surgical resection specimens. Cancer Cytopathol. 2017 Dec;125(12):896-907. doi: 10.1002/cncy.21937.

[4] Mark M Aloysius, et al. Predictive value of tumor proliferative indices in periampullary cancers: Ki-67, mitotic activity index (MI) and volume corrected mitotic index (M/V) using tissue microarrays. World J Surg. 2010 Sep;34(9):2115-21. doi: 10.1007/s00268-010-0681-3.

[5] Montse Verdu, et al. Cross-reactivity of EGFR mutation-specific immunohistochemistry assay in HER2-positive tumors. Appl Immunohistochem Mol Morphol. 2015 Sep;23(8):565-70.

[6] Qingling Wang, et al.  EPCR promotes MGC803 human gastric cancer cell tumor angiogenesis in vitro through activating ERK1/2 and AKT in a PAR1-dependent manner. Oncol Lett. 2018 Aug;16(2):1565-1570. doi: 10.3892/ol.2018.8869.

[7] Faustino J Suárez-Sánchez, et al. Macrophages in Oral Carcinomas: Relationship with Cancer Stem Cell Markers and PD-L1 Expression. Cancers (Basel) (IF: 6.13; Q1). 2020 Jul 2;12(7):1764. doi: 10.3390/cancers12071764.

[8] Qi Yue, et al. The prognostic value of Foxp3+ tumor-infiltrating lymphocytes in patients with glioblastoma. J Neurooncol. 2014 Jan;116(2):251-9. doi: 10.1007/s11060-013-1314-0. Epub 2013 Nov 26.[9] Christopher P Austin.Opportunities and challenges in translational science. Clin Transl Sci. 2021 Sep;14(5):1629-1647. doi: 10.1111/cts.13055.

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