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新聞資訊

美研| CMC系列(十):藥物雜質(zhì)研究策略之基因毒性雜質(zhì)

2024-01-19
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訪(fǎng)問(wèn)量:

開(kāi)篇引言

世界著名作家、大思想家斯賓塞·約翰遜曾經(jīng)說(shuō)過(guò)“唯一不變的是變化本身”,而在藥物研發(fā)過(guò)程中,藥物活性成分的合成往往伴隨著雜質(zhì)的生成,任何物質(zhì)的純凈程度只能無(wú)限接近100%,在人類(lèi)認(rèn)知的范圍內(nèi)目前還不存在100%純凈的物質(zhì),換句話(huà)說(shuō)“認(rèn)知中可以存在的純凈物質(zhì)那只有不純物了”。

1 藥物雜質(zhì)與基因毒性雜質(zhì)介紹

關(guān)于雜質(zhì),異于活性成分的物質(zhì)我們將其統(tǒng)稱(chēng)為雜質(zhì),這些成分通常是無(wú)效的、與活性成分使用目的無(wú)關(guān)或者是有其他毒副作用的物質(zhì)。而藥物的質(zhì)量研究過(guò)程就是通過(guò)目前人類(lèi)所掌握的分析手段,對(duì)異于活性成分的物質(zhì)進(jìn)行定性和定量研究,并基于ICH、藥典等相關(guān)指導(dǎo)原則并結(jié)合文獻(xiàn)數(shù)據(jù)等手段對(duì)這些雜質(zhì)進(jìn)行安全限度的制定和評(píng)估,藥物研發(fā)中的雜質(zhì)可分為有機(jī)雜質(zhì)(與工藝和藥物結(jié)構(gòu)有關(guān)的)、無(wú)機(jī)雜質(zhì)和殘留溶劑等。

雜質(zhì)的存在通常會(huì)帶來(lái)潛在的安全性風(fēng)險(xiǎn),對(duì)患者來(lái)說(shuō)有害而無(wú)益,其中高毒高活性雜質(zhì)、基因毒性(致突變、致癌性等)雜質(zhì)更是藥物研發(fā)過(guò)程中的控制重點(diǎn),其研究思路通常為雜質(zhì)的定性、雜質(zhì)的制備、結(jié)構(gòu)確證與表征、限度制定、控制方式制定、高靈敏度的分析方法開(kāi)發(fā)與驗(yàn)證等。

對(duì)于藥物的研制原則,通常遵循ICH相關(guān)指導(dǎo)文件的研究思路,即人用藥品注冊(cè)技術(shù)國(guó)際協(xié)調(diào)會(huì)議(The International Conference on Harmonisation of Technical Requirements for Registration of Pharmaceuticals for Human Use; ICH)。

ICH是由歐盟、美國(guó)、日本三方成員國(guó)于1990年共同發(fā)起,對(duì)三方成員國(guó)家的人用藥品注冊(cè)技術(shù)要求的現(xiàn)存差異進(jìn)行協(xié)調(diào)的國(guó)際組織。1994年3月15日,ICH Q3由指導(dǎo)委員會(huì)同意進(jìn)入第二階段,公開(kāi)意見(jiàn)征求,藥物研發(fā)過(guò)程中的雜質(zhì)研究進(jìn)入到了人們的系統(tǒng)關(guān)注中,從1995年3月30日開(kāi)始,ICH相繼發(fā)布Q3A(新原料藥中的雜質(zhì))、Q3B(新制劑中的雜質(zhì))、Q3C(雜質(zhì):殘留溶劑指南)、Q3D(元素雜質(zhì)指導(dǎo)原則),建立了ICH成員國(guó)和遵循ICH原則國(guó)家的統(tǒng)一雜質(zhì)研究標(biāo)準(zhǔn),具體的提出了雜質(zhì)控制策略和限度要求等內(nèi)容[1]

隨著科技的進(jìn)步和分析手段的完善以及人們對(duì)學(xué)科的認(rèn)識(shí)和對(duì)化合物的深入研究,發(fā)現(xiàn)某些雜質(zhì)在極低的濃度下即可誘導(dǎo)基因突變并導(dǎo)致染色體的斷裂和重排,具有潛在的致癌性,這類(lèi)雜質(zhì)人們將其定義為致突變雜質(zhì)。Q3A和Q3B僅能為大多數(shù)雜質(zhì)的定性和控制提供指導(dǎo),對(duì)DNA反應(yīng)性雜質(zhì)的指導(dǎo)很有限,2013年2月6日,ICH M7(基因毒性雜質(zhì))獲得執(zhí)行委員會(huì)批準(zhǔn),并且發(fā)布供公眾參考,為醫(yī)藥研發(fā)生產(chǎn)提供了一個(gè)用于致突變雜質(zhì)的鑒別、分類(lèi)、定性和控制的可行性框架方案,用于控制雜質(zhì)潛在的致癌性風(fēng)險(xiǎn)。至此,ICH針對(duì)藥物中雜質(zhì)研究的框架已基本搭建完成。

根據(jù)致突變潛力和致癌性對(duì)雜質(zhì)進(jìn)行分類(lèi),通常以數(shù)據(jù)庫(kù)和文獻(xiàn)的檢索獲得的雜質(zhì)致癌性和細(xì)菌致突變數(shù)據(jù)對(duì)實(shí)際和潛在雜質(zhì)進(jìn)行初步分析,危害性評(píng)估將其歸類(lèi)為1類(lèi)、2類(lèi)或5類(lèi)。若無(wú)法獲得這些數(shù)據(jù),則應(yīng)進(jìn)行預(yù)測(cè)細(xì)菌致突變性的構(gòu)-效關(guān)系(SAR)評(píng)估。根據(jù)評(píng)估結(jié)果將其分為3類(lèi)、4類(lèi)或5類(lèi)[2]

分類(lèi)定義擬定的控制措施
1已知致突變性致癌物控制不超過(guò)該化合物特定的可接受限度
2致癌性未知的已知致突變物(細(xì)菌致突變陽(yáng)性*,但無(wú)嚙動(dòng)物致癌性數(shù)據(jù))控制不超過(guò)可接受限度(適宜的TTC)
3有警示結(jié)構(gòu),與原料藥結(jié)構(gòu)無(wú)關(guān),無(wú)致突變性數(shù)據(jù)控制不超過(guò)可接受限度(適宜的TTC)或進(jìn)行細(xì)菌致突變?cè)囼?yàn);
如無(wú)致突變性,歸為5類(lèi)
如有致突變性,歸為2類(lèi)
4有警示結(jié)構(gòu),該警示結(jié)構(gòu)與原料藥或與原料藥相關(guān)化合物(例如,工藝中間體)相同,且原料藥或與原料藥相關(guān)的化合物經(jīng)測(cè)試為非致突變性按非致突變雜質(zhì)控制
5無(wú)警示結(jié)構(gòu),或由充分證據(jù)證明警示結(jié)構(gòu)無(wú)致突變性或致癌性按非致突變雜質(zhì)控制

上表中多次提到了警示結(jié)構(gòu),警示結(jié)構(gòu)是化合物結(jié)構(gòu)與生物活性的關(guān)系的研究總結(jié)的一系列結(jié)構(gòu),主要是結(jié)構(gòu)與毒理學(xué)毒性的關(guān)系,需要注意的一點(diǎn)是,有警示結(jié)構(gòu)的化合物不一定具有遺傳毒性,有遺傳毒性的化合物通常具有警示結(jié)構(gòu)。

目前,一般將致癌物分成兩大類(lèi):

一類(lèi)是遺傳毒性致癌物(geno-toxic carcinogens),通過(guò)化學(xué)鍵合直接破壞遺傳物質(zhì)產(chǎn)生致癌性,大多數(shù)的化學(xué)致癌物具有遺傳毒性;

第二類(lèi)是非遺傳毒性致癌物(epicarcinogens,或稱(chēng)為外遺傳性致癌物),通常不與DNA發(fā)生化學(xué)鍵合作用,不對(duì)DNA產(chǎn)生直接破壞,而是通過(guò)遺傳物質(zhì)外的間接機(jī)制引起致癌作用(如促進(jìn)細(xì)胞過(guò)度增殖等),這類(lèi)致癌物在致突變?cè)囼?yàn)(如Ames試驗(yàn))中一般呈陰性結(jié)果。

盡管非遺傳毒性致癌物的致癌作用機(jī)制各不相同,但遺傳毒性致癌物的作用機(jī)制卻表現(xiàn)出較高的一致性,這類(lèi)物質(zhì)具有DNA反應(yīng)活性,通過(guò)與遺傳物質(zhì)發(fā)生化學(xué)鍵合引起遺傳信息的改變并產(chǎn)生致癌性,基因突變往往是此類(lèi)物質(zhì)產(chǎn)生致癌性的起始步驟。遺傳毒性雜質(zhì)的警示結(jié)構(gòu)通常是指雜質(zhì)結(jié)構(gòu)中的某些特殊基團(tuán)或結(jié)構(gòu)分子。這些特殊的結(jié)構(gòu)單元具有與遺傳物質(zhì)發(fā)生化學(xué)反應(yīng)的能力傾向,一旦遺傳物質(zhì)發(fā)生改變則通常會(huì)誘導(dǎo)基因突變或者導(dǎo)致染色體重排或斷裂,因此具有潛在的致癌/致突變風(fēng)險(xiǎn)。Ashby等總結(jié)提出了18種警示結(jié)構(gòu)的模型,根據(jù)這18中警示結(jié)構(gòu)整合成的“超級(jí)致癌物”虛擬化合物分子。

超級(jí)致癌物的虛擬結(jié)構(gòu).jpg

超級(jí)致癌物的虛擬結(jié)構(gòu)

致突變雜質(zhì)的安全閾值較一般雜質(zhì)低很多,很低含量的情況下便可可能會(huì)引發(fā)致突變或致癌,因此對(duì)其控制要求更加嚴(yán)格,對(duì)工藝要求和對(duì)分析檢測(cè)能力的要求也非常高。警示結(jié)構(gòu)對(duì)于雜質(zhì)的遺傳毒性和致癌性具有提示作用,對(duì)于警示結(jié)構(gòu)的早期識(shí)別和規(guī)避有助于提高藥物研發(fā)的效率、降低生產(chǎn)和控制成本。正如上文所說(shuō),致癌性雜質(zhì)可分為遺傳毒性和非遺傳毒性,在結(jié)構(gòu)上可分為遺傳毒性致癌性警示結(jié)構(gòu)和非遺傳毒性致癌性警示結(jié)構(gòu)[3],如下表:

遺傳毒性致癌性雜質(zhì)的警示結(jié)構(gòu)-1.jpg

遺傳毒性致癌性雜質(zhì)的警示結(jié)構(gòu)-2.jpg

遺傳毒性致癌性雜質(zhì)的警示結(jié)構(gòu)-3.jpg

就像上文中所提到的,含有警示結(jié)構(gòu)的化合物不一定具有遺傳毒性,而有遺傳毒性的化合物也不一定會(huì)產(chǎn)生致癌性。遺傳毒性雜質(zhì)的限度計(jì)算通常包含TD50、TTC法等,篇幅有限這里不做更多的說(shuō)明。

化合物是否具有遺傳毒性,單單從是否含有警示結(jié)構(gòu)上判斷是不夠科學(xué)也不夠嚴(yán)謹(jǐn)?shù)模€需結(jié)合化合物相關(guān)毒理學(xué)文獻(xiàn)檢索,雜質(zhì)化合物軟件評(píng)估預(yù)測(cè)以及Ames試驗(yàn)等進(jìn)行判斷,基于大量理論研究和實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)總結(jié)出的警示結(jié)構(gòu),對(duì)于雜質(zhì)的潛在致癌性有一定提示作用。因此在進(jìn)行雜質(zhì)安全性評(píng)估和控制策略選擇時(shí),對(duì)于缺少遺傳毒性數(shù)據(jù)的雜質(zhì),警示結(jié)構(gòu)作為區(qū)分普通雜質(zhì)和“高活性”雜質(zhì)的標(biāo)志可以提高篩選效率、減少毒理學(xué)評(píng)價(jià)的工作量。但是應(yīng)當(dāng)指出,警示結(jié)構(gòu)的存在與否并不能明確給出該雜質(zhì)是否具有遺傳毒性和致癌性的結(jié)論。對(duì)于缺少遺傳毒性數(shù)據(jù)的雜質(zhì),警示結(jié)構(gòu)可以作為辨識(shí)遺傳毒性和致癌性雜質(zhì)的起點(diǎn),之后才會(huì)考慮啟動(dòng)構(gòu)-效關(guān)系預(yù)測(cè)和體內(nèi)外安全性研究,以進(jìn)一步確認(rèn)該雜質(zhì)是否具有遺傳毒性和致癌性。

2 美迪西設(shè)備技術(shù)和服務(wù)

美迪西是一家專(zhuān)業(yè)的生物醫(yī)藥臨床前綜合研發(fā)服務(wù) CRO,其中藥學(xué)研究板塊CMC包括原料藥研究、質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)建立、穩(wěn)定性研究和申報(bào)服務(wù)。在致突變雜質(zhì)研究的方向,美迪西具有專(zhuān)業(yè)的雜質(zhì)評(píng)估團(tuán)隊(duì),可支持毒性試驗(yàn)研究、Ames試驗(yàn),同時(shí)引入了專(zhuān)業(yè)結(jié)構(gòu)評(píng)估軟件 Case Ultra,軟件同時(shí)包含基于統(tǒng)計(jì)學(xué)的和基于專(zhuān)家規(guī)則的模型,兩個(gè)模型組合可以完整的滿(mǎn)足ICHM7 要求。對(duì)于致突變雜質(zhì)的研究,美迪西有專(zhuān)業(yè)經(jīng)驗(yàn)豐富的雜質(zhì)定性定量研究團(tuán)隊(duì)和國(guó)內(nèi)先進(jìn)的儀器設(shè)備,儀器包括 Bruker 400M HMR、Agilent 5977A GC-MS、Agilent 7000D GC-MSMS、Agilent/SHIMADZU/Thermo Fisher LC-MS、Agilent 6470 LC-MSMS、Thermo Fisher Q Exactive Plus HRMS 等。

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3 美迪西案例分享

某原料藥在合成制備工藝中,根據(jù)評(píng)估分析可能因試劑和工藝過(guò)程引入苯、烯丙基溴、烯丙基氯和1-溴-3-氯丙烷,根據(jù)ICH Q3C殘留溶劑部分,苯歸屬于1類(lèi)溶劑,屬高毒高活性雜質(zhì),期限度為2ppm;烯丙基溴、烯丙基氯和1-溴-3-氯丙烷,根據(jù)結(jié)構(gòu)判斷其屬于鹵代烷烴類(lèi)化合物,含有鹵代烷烴警示結(jié)構(gòu),使用Case Ultra基于統(tǒng)計(jì)學(xué)的和基于專(zhuān)家規(guī)則的模型評(píng)估,軟件模擬結(jié)果烯丙基氯和1-溴-3-氯丙烷雜質(zhì)分類(lèi)為1類(lèi),烯丙基溴雜質(zhì)分類(lèi)為2類(lèi)。

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查閱相關(guān)文獻(xiàn)并結(jié)合原料藥的最大使用劑量,從嚴(yán)控制雜質(zhì)限度,最終確定苯的限度2ppm、烯丙基溴38ppm、烯丙基氯35ppm、1-溴-3-氯丙烷30ppm。

采用GC-MS定量檢測(cè),在Scan模式下確定各組分化合物的定性離子和定量離子。70eV條件,Scan模式下總離子流質(zhì)譜信息如下:

采用GC-MS定量檢測(cè),Scan模式下總離子流質(zhì)譜信息-1.jpg

采用GC-MS定量檢測(cè),Scan模式下總離子流質(zhì)譜信息-2.jpg

采用GC-MS定量檢測(cè),Scan模式下總離子流質(zhì)譜信息-3.jpg

采用GC-MS定量檢測(cè),Scan模式下總離子流質(zhì)譜信息-4.jpg

在排除各組分化合物互相干擾的離子情況下,確定各組分的定性和定量離子,苯的定性離子m/z 51和m/z 77,定量離子m/z 78;烯丙基溴m/z 81和m/z 122,定量離子m/z 120;烯丙基氯m/z 75和m/z 78,定量離子m/z 76;1-溴-3-氯丙烷m/z 79和m/z 156,定量離子m/z 158。

在排除各組分化合物互相干擾的離子情況下,確定各組分的定性和定量離子-1.jpg

在排除各組分化合物互相干擾的離子情況下,確定各組分的定性和定量離子-2.jpg

在排除各組分化合物互相干擾的離子情況下,確定各組分的定性和定量離子-3.jpg

在排除各組分化合物互相干擾的離子情況下,確定各組分的定性和定量離子-4.jpg

定量模式SIM模式下,各組分化合物滿(mǎn)足ppb級(jí)別極低的靈敏度要求。

參考文獻(xiàn)

[1] ICH Q3A(R2) 新原料藥中的雜質(zhì)

[2] ICH M7(R2) 遺傳毒性雜質(zhì)

[3] 馬磊,馬玉楠,陳震等.遺傳毒性雜質(zhì)的警示結(jié)構(gòu)[j].中國(guó)新藥雜志,2014,23(18):2106 2111)

美迪西雜質(zhì)制備和結(jié)構(gòu)鑒定平臺(tái).jpg

美研|CMC系列回顧

CMC系列(一)淺談藥物研發(fā)中原料藥工藝研究的重要性

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